對於宋應星的到來，朱由榔當然驚喜，如今的武備局和工部並不缺乏工匠，真正缺乏的是真正具有遠見，可以統籌全局的科工帶頭人。
胡璿雖然也努力用事，但畢竟之前一直都是傳統儒家官僚，對於工業和技術的認識也就這大半年才建立起來，做一做人事安排上的工作還行，但要是讓他規劃研究方向，指出那些技術應當優先研究，那些可以放一放，就難為人了。
而宋應星補上了這個空缺，宋應星不是一個專精某行業的科學家，而是一個“百科全書”式的科技人才，他對當下幾乎所有工業門類都有所涉獵，能夠清晰地看到技術發展脈絡，朱由榔隻需要給出一個大致方向，就能交予宋應星做具體規劃，該研究哪些，不該研究哪些，這就是後世所謂的“戰略科學家”。
朱由榔二話不說，便讓宋士意帶路，登門拜訪。
宋應星自從來到廣東後，讓兩個兒子去朝廷應聘，眼下肇慶朝廷求賢若渴，無論功名，隻要是讀書人，都是有崗位的。
老大宋士慧當了縣主簿，參與農業改革，老二宋士意則去了武備局，成了技術官員。
至於宋應星本人，這些天和那個叫做顧炎武的後輩一起，在廣州和肇慶兩府考察。
得到的反饋是讓他們大為鼓舞的，種種跡象表明，這個位於嶺南一隅的新朝廷卻有截然不同的新朝氣象。
顧炎武選擇去百廢待興的湖廣，應聘成為一任縣丞，而宋應星則打算在廣州安頓下來，他原本是南直隸亳州知州，隻要在吏部掛上名字，便能重新以舊吏身份分配崗位。
朱由榔登門拜訪，讓這位已然六十歲的老先生受寵若驚，他雖然是科學技術上的巨人，但那畢竟是後世，如今的宋應星不過隻是蹉跎大半生，舉人出身的一個退休地方官而已。
朱由榔連忙將激動的宋應星扶起
“長庚先生，‘工欲善其事，必先利其器’，如今國難未靖，正需兵戈之用，朕聽聞先生於工繕一道建樹非凡，故欲請先生出山，替朕打理軍工事宜。”
宋應星連呼不敢
隨後朱由榔傳旨加封其為工部右侍郎，武備局大將作（總工程師），打理武備局全部事宜，如此一來，胡璿這個工部尚書抓總，自己新提拔的工部左侍郎王應龍（原大西政權工部尚書）打理礦務局，宋應星打理武備局，工部的三駕馬車便由此建立起來。
朱由榔還向宋應星詢問了《天工開物》的編寫情況，得知此時《天工開物》已經成書並且刊印出版，便讓廣州府刻板印刷，同樣作為肇慶朝官吏的參考書目之一，隻不過主要針對工部官員。
正當他心情大好之時，一封瞿式耜從肇慶遞來的奏折，卻一下子將好心情都破壞掉了。
“又來！這幫子文官又開始了！一頓不打欠收拾是吧？”
就在朱由榔南巡之時，新任貴州巡撫王化澄與僉都禦史章曠、吏部尚書何騰蛟起了衝突。
事情的起因是件小事，王化澄和堵胤錫一樣，都是當初就主張與順軍餘部聯合抗清的文官。
貴州多山地，種植稻米收成有限，倒是種起番薯、玉米等作物還不錯，於是就成了這次農業改革的重點之一。
章曠按照政策，本來是和戶部給事中金堡等人一起被抽調為巡視組，巡查貴州農業工作，可章曠這廝卻擺出了‘欽差’的架子，來到貴陽後，正巧碰見被從湖廣掉入貴州參加雲南戰役的前軍參將塔天寶。
有明一朝，都察院的禦史地位很高，僉都禦史那都是可以出任巡撫的，當初堵胤錫為湖廣巡撫時也不過就是僉都禦史銜而已。
塔天寶曾經在忠貞營時被章曠轄製過，但其人對於章曠向來沒什麼好印象。按照明朝中後期的官場規則，塔天寶一個參將，遇到了自己之前的“恩主”是應當帶上禮物登門拜訪的。
但塔天寶不僅沒有來拜訪，而且還在兩人偶遇時以平禮相見，未執下官禮。
章曠大怒，罵道
“爾不分尊卑乎？果流賊習氣！”
塔天寶聽到對方罵人不說，還拿那以前農民軍的蔑稱來稱呼自己，憤而回道
“你我何尊何卑？俱為四品，如何見禮？”
章曠一怒下找到貴陽知府連城璧，要他約束自己地界上的將領，可連城璧卻表示，自己乃是文職，而且同是四品，豈能約束軍將？
章曠大為震驚，的確，明朝的知府是正四品官，僉都禦史同樣是四品，但僉都禦史卻一般能當巡撫，管一個省的，所以麵對僉都禦史時，知府也好，將領也罷，都是算作下官。
而塔天寶和連城璧竟然如此對待自己，越想越氣，幹脆和戶科給事中金堡一同上了折子，彈劾二人。
瞿式耜倒是識大體的留中不發，也不表態，但吏部尚書何騰蛟卻反應激烈，表示這是目無上官，應當嚴懲，還利用吏部尚書的職權下公文嗬斥貴陽知府連城璧。
說他“無士大夫氣節自持。”
外出的貴州巡撫王化澄聽聞此事，對何騰蛟十分惱火，上書彈劾何騰蛟、章曠。
言道何騰蛟、章曠當年明明收到了隆武皇帝調兵旨意，卻逡巡不前，就是怕隆武到了湖廣威脅他的權勢，坐視隆武殉國，早就該殺！
而朱由榔收到這封信卻是生氣在兩點。
其一，何騰蛟、章曠二人死性不改，還是那一套蔑視農軍的態度，若是長久放縱下去，有傷軍心。
其二，這都什麼時候了？怎麼明朝之前那套官場腐朽之風還在盛行？瞿式耜留中不發，本來就表示曖昧態度，其實不止他，對所有知情的朝中重臣而言，他們內心中其實是認同章曠那套說法的。在他們眼裏，區區一個參將，地位就是要比僉都禦史低啊！雖然他們都是正四品，但這也不能比。
他們看來，章曠道理是沒錯的，隻是方法欠佳而已，沒必要把事情鬧得這麼大，所以自己“留中不發，兩不表態”，就是在“主持公道”了。
這才是令朱由榔最憤怒的地方，他突然發現，自己雖然已經在竭力改變肇慶朝廷的官場風氣，但明中期以後那些個“條條框框”的腐朽之風依舊吹了進來，並且隨著政權進入穩定後，大家沒有顧忌後，快速滋養而出。
在這些官吏眼裏，之前大半年那種緊張局勢下的所作所為，與民軍聯合也好，重視軍士也好，都不過是“權宜之計”，一旦社稷穩固，還是要回到以前“眾正盈朝”的狀態嘛！
朱由榔放下廣州這邊事情，直接帶著兩百騎兵快馬加鞭，氣衝衝跑回肇慶。
“何騰蛟呢？還有章曠那王八蛋呢？”
陳子壯見到天子一副擇人而噬的模樣，有些疑惑道
“何尚書正在肇慶，章曠還在貴陽，陛下......”
“章曠不用回來了！貶海南島，當個知縣，不，可別禍害了一縣老百姓，就當個主簿吧！”
“這是不是太......”
“明日召所有在肇慶官員，開大朝會！”
朱由榔這回決心要打壓一下這些個文官氣焰了，必須要讓他們意識到，時代已經變了，以前嘉靖、萬曆時期那一套已經是過去了，文武之間也好，都察院也好，之前大半年自己為了抗清，對於原來的明朝舊吏可謂來者不拒，如今看來，有些時候，有必要做一些清洗和甄別。