與希巴過招後的幾天，眾人來到一座不知名的小山裏紮營，因為這次的特訓僅僅隻是訓練神奇寶貝，所以小修和小智都沒有使用波導勘察周圍，就在這裏直接特訓。
“鴨嘴火龍！噴射火焰！”
“臭臭泥！使用汙泥炸彈！”
“裝甲！撕裂爪！”
“小皮！劈瓦！”
小修等人用小時候特訓的老辦法訓練，這次他們訓練的是自己收服的神奇寶貝之一，因為一旦參加比賽，隻要不出意外，進入八強，就一定要用六隻神奇寶貝，所以他們決定讓自己的每一隻神奇寶貝都接受特訓，今天輪到這幾隻，他們的雙打組合是這樣的：小智和小修小茂和小藍，一天換一次。
“鴨嘴火龍！讓對麵那個笨蛋瞧瞧我們的厲害！使用過熱！”
“既然你想拚！我跟你拚到底！臭臭泥！垃圾射擊！”
“既然如此小藍，咱們也拚一下吧，裝甲！破壞死光！”
“哼！小皮！大字爆炎！”
就在這四個大招即將碰撞在一起的時候，波克比竟然突然出現在那四個大招即將碰撞在一起的地方！
波克比的出現嚇壞了眾人，小藍和小修趕緊用超能之力把攻擊轉移到岩壁上，波克比總算沒受到傷害。
“波克比！”塞蕾娜趕緊跑到波克比的身邊，緊緊把它抱在懷裏，流下眼淚說：“不要嚇我啊，我都快被嚇死了。”
“塞蕾娜！你怎麼沒把波克比看好啊！要是波克比出了什麼事可怎麼辦！”小霞大聲嗬斥她說。
“對不起，隻是一時間沒注意”塞蕾娜說話的聲音越來越小聲，看樣子都快哭出來了。
“應該是波克比自己用瞬間移動到哪裏去的。”小修說。
“怎麼可能！波克比還小，不可能會這招的。”小智說。
“如果它會的不是瞬間移動，而是揮指呢？”
“揮指！這個招數也是一個大招！它怎麼會呢？”小茂說。
“那我問你們，你們覺得波克比是會瞬間移動來的現實，還是揮指更有可能呢？”小修反問道。
“呃”被小修這麼一問，大家忽然覺得，波克比可能會的真的是揮指，小黃說：“如果波克比它用的真的是揮指的話，那麼它會突然出現在那裏也就可以解釋清楚了，因為是第一次用不熟練。”
“不過如果真是這樣的話那就糟糕了，因為揮指可是隨機性招式，萬一它再用揮指，誰敢保證下一次它不會用個危險的招式？”小剛說。
“確實，萬一它使用大爆炸什麼的，那真的太危險了。”小茂說。
“那怎麼辦？”塞蕾娜問。
“隻能大家以後多注意注意波克比，一旦發現它使用揮指，立馬讓它停下！”小修說。
“就目前看來也隻能這樣了，嗯？你們看！岩壁！”小霞的話讓眾人的目光瞬間轉移到岩壁，眾人也在這時才注意到，被打碎的岩壁露出一個遺跡，遺跡最上方是一口古老的古鍾，下方擺放著一個金色的物品，小藍用超能力偵測，驚訝的說：“裏麵有一隻神奇寶貝！”
“嗯，而且這口大鍾裏也有。”小修說。
“在我們的正下方還有一個。”小智說。
“每到這個時候本少爺都特別羨慕你們的這個能力！”小茂不爽的說。
這時一個奇怪的女孩突然出現，一把奪過小藍手中的金色物品，仔細觀察，最終確認說：“這個不會錯的！”
“你誰啊！剛剛出現的時候竟然沒察覺到你！”3
少女可不管他們，而是對她的同伴招手說：“團長！發現金色之眼了！”
那個被少女稱呼團長的人拿著金色物品說：“終於發現了嗎？你幹的很好。”
小剛趁機上前說：“你好！我是第一個發現者！我叫小剛！今天黃道吉日！事業有成”小剛話還沒說完，就被小修和小茂爆栗，並且拉走，塞蕾娜過去說：“抱歉啊，我們的同伴說了很多多餘的話。”
少女激動地抓起塞蕾娜的手說：“才沒這回事呢！太感謝你們了！我叫懷特！請多多指教！”
她轉過身去對她的團長說：“可是我沒想到竟然這麼快就發現了！我有點不敢相信！”
“那個”小霞想問他們到底是什麼人的時候，那個團長說：“做得好，博士，這下子你的假設等於獲得了證實。”
“那個”小黃和小霞。
“把營地轉移到這裏吧，團長，我要徹底調查這片區域。”懷特說。
“哈哈哈哈！我早就轉移過來了！”這個團長竟然真的很快就把他們的營地轉移到這裏，連懷特都心生佩服，這時懷特才注意到他們，此時小茂他
“哈！”小茂用包裹了禦龍之力的手狠狠捶向遺跡旁邊的岩壁，然後砸出了另一個人遺跡，小藍從遺跡裏用超能力拿出了一個黑色的啞鈴，就在這時，黑色的啞鈴發出耀眼的紅光，試圖想把周圍的人都吞噬進去，塞蕾娜他們有小黃保護，其他人也因為自身的能力沒有被那紅光吞噬，可憐的火箭隊就這樣還沒說出場台詞就被吞了進去，小智說：“大家！準備戰鬥！”
這個時候，黑色的啞鈴開始慢慢變大成型，變成了一個有著奇怪紋理的超巨大耿鬼，小蜻此時突然跑出來，向它哀嚎。
“小蜻，你突然對它哀嚎幹嘛？”小修不解地問。
（我能感覺得到。）小蜻流下眼淚說：（它和我一樣，是被改造的神奇寶貝。）
“它也是被改造的神奇寶貝！”5
“納尼！”
就在這時，那個被稱作金色之眼的東西發出金光飛了出來，同時一個金色的湯勺也跟著出來，湯勺好像要是一般插在金色之眼的孔上，然後金色之眼變成了同樣有奇怪紋理的超巨大胡地。
“怎麼辦？他們看起來要打起了。”塞蕾娜說。自從見到夢幻這些傳說神奇寶貝後，她已經完全不怕那些體型巨大的神奇寶貝了，麵對它們都可以做到和它們談笑風生了。
“先讓被抓住的人睡著再說，塞蕾娜，該你的胖丁出場了。”小修說。
“哦，胖丁，唱歌。”塞蕾娜放出胖丁的同時，小藍也做了個精神護罩，保證他們既是聽了胖丁的歌也不會睡著。
胖丁開始唱歌，在它唱歌的時候，古鍾發出光芒，等它唱完的同時，古鍾也不再放光，同時緩緩飛到那兩隻神奇寶貝的麵前，然後古鍾內部發出粉色光芒，從光芒裏出現了一隻也有奇怪紋理的超巨大胖丁，塞蕾娜察覺到不對勁的地方，趕緊把胖丁收回，同時叫小藍不要撤掉精神護罩，這時大胖丁拿起它頭上的古鍾，拿它當麥克風唱歌，竟然讓那兩隻神奇寶貝睡著了！然後它一怒之下也作出原著中塞雷娜的胖丁的舉動：塗鴉，最終它們幾個變回原來的樣子，同時被抓住的人也被放了出來。
撤掉護罩後，小藍問：“接下來該怎麼辦？”
“等他們醒來後，我來說明好了，先把這些東西放回原位，然後我跟老媽他們聯絡一下，問問這到底是怎麼回事？”小修說完，便走進他們的營帳裏，發現了一塊刻有超古代文字的石板，小修發現他竟然能看懂石板上的內容，上麵寫的是：毀滅世界的兩股力量，黑色的黑暗，染黑了天空，金色的眼眸，擾亂了氣，把世界分成兩半的鬥爭，人們束手無策，天空開啟異界之門，這個時候，平息一切的力量化成圓球回到地平線底下。這時他也想起來如果不是因為他的到來而發生改變的話，石板上的內容真的會被驗證的，這樣他感到更奇怪了，於是他趕緊用實況接收器呼叫他的老媽，這時眾人也進來，打算問問小修的母親有關超古代的事。
實況接收器接通了，可他們看到的是正在泡溫泉的安傑拉，安傑拉問：“啊啦啊啦，兒子你如果想看你老媽我性感的裸體的話直說就是，怎麼叫這麼多人來一起看呢？”說完正準備起身。
眼看事態馬上就要成人化了，小修可不打算便宜某個眯眯眼色狼，於是趕緊說：“我要知道超古代的真麵目！”
一聽到小修問的問題，安傑拉立馬合上實況接收器，掛斷聯絡。
“老媽，你就這麼不想再提起嗎？”小修有些失望地說。
這時小修的實況接收器突然有聯絡請求，小修一接，發現是他老媽，安傑拉說：“你會問我超古代的是想必是因為你看到了某塊記錄超古代文字的石板，你不用急著回答！也不能問我問題，你們幾個也是！就這麼麼靜靜的聽我說。”說著緩一口氣，說：“如今的考古界挖到的刻有超古代文字的石板或者遺跡，大部分都是假的，為了隱藏真正的超古代而迷惑後人用的，可以這麼說，刻有超古代真相的石板基本沒幾個，隻有那些早在超古代就存在的家族還存有。超古代一共有三種文明組成：一種是你們現在的文明，在我們那個年代被稱作和平文明，還有就是將神奇寶貝供奉為神明的文明，也就是神獸文明，最後一個就是我們國家的文明：眾神文明，因為隻有我們國家的人才能擁有賜予之力。三大文明有三大文明不同的與神奇寶貝的相處之道，和平文明他們認為與神奇寶貝成為朋友就是等於回歸自然，所以他們不會做出傷害神奇寶貝的事，甚至在他們眼裏神奇寶貝比人還重要；神獸文明的人認為神奇寶貝是神明的後裔，也就是神之子，尤其是傳說神奇寶貝和幻之神奇寶貝，更是被尊稱神獸。”
“神獸？那我上次這麼稱呼啦啦它為什麼不高興？”
（很簡單，因為這個稱呼讓我們有心理陰影。）啦啦跑出來說。
“什麼心理陰影啊？”小黃問。
“我來解釋吧，這一切是我們國家害的，也就是眾神文明，當時的我們認為我們自身才是真正的神明，把其他人看做低等的賤民，把神奇寶貝看作奴隸，就連神獸也不放在眼裏，因此我們是不是就會騷擾別的國家的人和神奇寶貝，甚至發動過戰爭要把那兩個國家吞並，然而阿爾宙斯的出現讓我們打消了念頭，它強大的力量我們無法反抗，我也被阿爾宙斯親手廢掉我自己的賜予之力，然後被你爸救了過來，說來可笑，你爸他正是和平文明的人，他看到我有難，就出手救了我，我也是在那個時候愛上了他，後來我被我們國家的人找到，他們檢查我的身體，發現我並未懷孕，就把我帶回，當時你爸他根本無力阻攔，隻能眼睜睜地看著我被他們帶走。他們把我帶回去的時候，我一直以為我會受到什麼虐待，然而他們隻是威脅我說如果我不幫忙做實驗的話，馬特修斯就會死，不得已，我就幫他們做實驗，卻是成了我這輩子一直都要背負的罪孽”說著安傑拉不敢再說下去了。
“是把神奇寶貝拿來改造的吧？而且是從蛋開始改造。”小修說。
“你怎麼知道！”安傑拉驚訝地問。
“小蜻做噩夢的時候，我無意間看到了噩夢的內容，把神奇寶貝改造的夢。”
“小蜻嗎？難怪，那孩子就是當年‘造神計劃’僅有的成功幸存下來的神奇寶貝之一。”
“那剩下的呢？你不會也帶到這個時代了吧？”
“沒有，它們基本都消失在曆史的長河裏，那些雖然改造失敗卻幸存下來的，被我們封印在一些容器裏。”
他們瞬間明白金色之眼黑色啞鈴和古鍾裏的神奇寶貝是怎麼回事了。
“我唯一帶走的隻有小蜻這個孩子而已，而且我們當時的造神計劃是建立在那些神獸們差點滅絕的基礎上。”
“這是怎麼回事！”
“為了創造新的神獸，我們將原本就存在這世間的神獸們抓來，我們最先抓到的就是固拉多和蓋歐卡，因為它們的力量基本可以說是無窮無盡，結果他們的力量被我們抽取的太多，變成了後來世人所見到的樣子，連實力也跟著倒退了很多，想要恢複巔峰的形態，就隻能依靠龍脈的力量。”
“這樣啊。”（原來這就是固拉多和蓋歐卡會有原始回歸這一形態的原因啊。）
“被抓住的還有烈空坐瑪納霏帕魯奇亞帝牙盧卡騎拉帝納時拉比一族謝米一族，鳳王洛奇亞酋雷姆萊希拉姆捷克羅姆克雷色利亞一族達克萊伊一族哲爾尼亞斯伊菲爾塔爾基格爾德蒂安希波爾凱尼恩雷吉洛克雷吉艾斯雷吉斯奇魯雷吉奇卡斯。除了還沒誕生的一些神獸，就隻剩下夢幻還沒找到，夢幻的行蹤比想象中的更難找，所以他們放棄尋找夢幻，隻用那些神獸做實驗，能夠被抽取基因的神獸毫不例外都被抽取出了基因，不能抽取的就直接將它們體內的能量抽取出來，得到我們想要的東西。”
“什麼東西？”8
“那東西你們不知道來得好，總之因為不斷抽取的原因，時拉比謝米克雷色利亞和達克萊伊一族，都差點滅亡，後來夢幻和馬特修斯一起帶著阿爾宙斯出現在我們的麵前，阿爾宙斯一出現，就是直接將賜予之力全部廢掉，同時打算將所有的擁有賜於基因的人全部殺掉，當時包括我，還是你父親拚死保護了我，不然我不可能和你父親最終在一起，並且懷上你。”
“那些人呢？阿爾宙斯真的把他們都殺掉了嗎？”塞蕾娜問。
“沒有，阿爾宙斯最終還是沒有下手，隻是單純將賜予基因破壞掉，讓他們的後人再也無法擁有這種力量，然而”
“然而什麼！”8
“然而有人逃走了，他僥幸很晚回來，所以他體內的賜予之力沒有被廢掉，同時帶走了幾乎所有實驗成功的蛋，唯獨沒有帶走的隻有我懷裏抱著的小蜻，剩下沒有被封印，且同樣也是實驗成功的神奇寶貝，阿爾宙斯將它們放歸野外，同時封鎖住它們體內的被改造的基因，讓它們的後人不會發生異變，現在很多珍惜物種的神奇寶貝之所以個體如此稀少就是因為當年的實驗害的。”
“那麼那個擁有賜予之力的人呢？”小修問到重點。
“阿爾宙斯任命我們穿越時空，去找到他，我們穿越時空，來到十一年前，當時我們一邊尋找一邊做讓你出生的事，結果就”說到後麵安傑拉都臉紅了，當然眾人也臉紅了，哪怕她說的再委婉但這話總是真的不能說出來啊！
“之後我們搬到真新鎮，學習這個時代的文字和知識，然後在你三歲那年離開你，去找他，我們隻所以每次即使回來也不會親自去找你，是因為我們一旦沾染上你身上的賜予之力，要找到他就更不可能了。”
“這是為什麼！”小修不解地問。
“因為賜予之力在幼年體上容易出現暴走現象，而且賜予之力一旦暴走，會殃及周邊的生命！導致他們的死亡！”
“誒”5（誒）4
“你們幾個這是什麼反應！”
“在我六歲的時候，我體內的賜予之力爆發過。”
“納尼！難道說”
“嗯，我們當時就在他身邊。”4（嗯，我們當時就在他身邊。）4
“這是不可能的！我親眼見過有人因為賜予之力暴走結果喪失了上百條生命！你們竟然沒事！”
“誒這麼猛！莫非是她保護了小智他們？”
“她是誰？”
“我也不知道，我在夢裏見過的，一個長著白發的姐姐，嗯放在現在我差不多該叫她阿姨了。”迷之空間裏正在給花花草草澆水的阿爾宙斯：啊楸！咦？奇怪？誰在背後說我壞話啊？
“阿姨？白發？不會是它吧？如果是它的確有這能耐。”
“你說的它不會是阿爾宙斯吧？”
“嗯，確實是它，四年前你的暴走一定是它救了你們幾個孩子的命，不然你們不可能活到現在的。”安傑拉肯定的說。
“那我們以後見到它一定要好好道個謝了！”小智說。
“別傻了，人家阿爾宙斯可沒那麼容易就能見到，好了，我能告訴你的就這麼多，剩下的我希望你不要去尋找，因為那些都太過黑暗。”
“我知道了，對了，我們找到了幾隻被封印住的神奇寶貝，怎麼辦？”
“就讓它們一直被封印住比較好，因為這樣做可以保護它們。”
“好，我知道了。”
“那就這樣吧兒子，對了，藍素和藍洛雖然不是超古代的，但也被改造過。”
“納尼！”8
“放心，沒有對它們做什麼，隻是讓它們可以對賜予之力敏感起來，是阿爾宙斯弄的，隻要你體內的賜予之力問題解決，它們的敏感體質就會消失。”
“早說”眾人頓時鬆了口氣。
“好了兒子，再說再見之前能不能滿足媽媽一個小小的要求呢？”
“你說吧。”
“我想看你變成女生後穿水手裝女仆裝死水庫比基尼白領服”安傑拉話還沒說完，小修直接合上實況接收器，斷開通信，陰著臉對其他人說：“請你們立刻忘記剛才我老媽說的話。”
“我們隻記得超古代的事！”7