在前往枯葉市的途中，大家遇到了非常多的事：與連勝了98場的小明戰鬥，中途火箭隊前來做壞事，被打飛；一行人在穿過一個不知名的森林裏遇到有人被欺負，小智替他解圍，小修了解事情原委後便跑到神奇寶貝學校去砸場子，他那些精辟的戰鬥理論就連校長都感到佩服，可當校長想挽留小修時，火箭隊又跑出來搗亂，又一次被打飛；來到神奇寶貝療養場，火箭隊要搶神奇寶貝，被小智和小修再次打飛，之後小翠讓他們帶走一些神奇寶貝，小智按原著劇情帶走了妙蛙種子小修帶走了走路草，並給它取名花鈴小霞小藍和小剛則沒有要任何神奇寶貝小黃帶走了一隻綠毛蟲，並取名小蝶塞蕾娜則帶走了一隻海星星；之後他們遇上了原著中的小火龍，小修想讓那隻小火龍認清那個人的真麵目，讓小智強行把它收服，並且將它帶在身邊，之後小火龍親眼見識到那個家夥的可惡，一怒之下，小火龍竟然學會了“噴射火焰”，不過也差點釀成火災，之後火箭隊又跑出來鬧事，又一次被打飛；之後一行人有如原著般遇到了傑尼龜軍團，後來它們被火箭隊利用，小智把它們救了出來，把火箭隊再次打飛，傑尼龜被小智打動，決定跟著他，不過小修並不打算讓剩下的傑尼龜當消防員，他和塞蕾娜小霞小剛一起分別收服了剩下的傑尼龜，小修給自己的傑尼龜取名傑克；之後一行人來到了正輝的燈塔，小智收服了原著中那隻發育不良的大鉗蟹，還見到了那隻巨大快龍，小黃通過常磐之力很清楚地了解到這隻快龍命不久矣，並且它還有一個後代要撫養，於是她答應它一定會代替它好好照顧它的後代，於是巨大快龍帶著小黃到它的巢穴裏，可火箭隊突然跑出來搗亂，攻擊了巨大快龍和小黃，巨大快龍一怒之下把火箭隊打飛，之後讓小黃帶走它的孩子，小黃一看，是一隻閃光迷你龍，身體顏色是紫色，於是小黃給它取名小紫。
在經曆了這些波折，一行人終於抵達枯葉市。
“終於！終於抵達枯葉市了”7
“啊我發誓！等解決完小修你的賜予之力！我馬上跟你們分道揚鑣！”小藍激動地說。
這也難怪，在小智的帶領下，一行人走到了連導航也找不出來的路段，因此，大家不得不放棄導航，依靠小智的波導之力指路，可卻證明了小修說的“小智哪怕有波導之力還是會指錯路！”，所有人也因此繞了這麼遠的路才終於抵達枯葉市，要知道，從華藍市出發，隻要走上正確的路，到達枯葉市所用的時間也就兩天，可他們卻花了七天，可見讓小智帶路的錯誤有多大。
“確實！小智！我是再也不相信你的波導之力了！”塞蕾娜說。
“現在在我們看來讓任何人指路都比讓小智哥哥指路來得好。”小黃說。
“你們”咕咕咕
小智一下子就癱倒在地上，說：“好餓”
皮卡丘也跟著癱倒在地上，說：“皮卡”（我也是）
“說起來我也餓。”小修說。咕咕咕
（不是隻有你餓。）小蜻從精靈球裏跑出來說。咕咕咕
咕咕咕5
“嗬嗬，看來大家都餓了。”塞蕾娜害羞的說。
“我們去神奇寶貝中心吃飯吧！”小剛提議說。
“吃飯！”小智皮卡丘和小蜻一聽到“吃飯”這字眼，馬上滿血複活，小智用波導之力勘測下哪裏有神奇寶貝中心。
“找到喬伊小姐的波導了！給喬伊家族強化了下基因飯！我來了！”小智此時就像打了興奮劑似的，以每分鍾一馬赫的速度衝向神奇寶貝中心。是真的以這速度衝向神奇寶貝中心！連皮卡丘和小蜻也一樣，不過小蜻是用飛的。
“好好快！”小黃小霞小剛和塞蕾娜驚訝到下巴都快掉了。
“好久沒看到小智跑這麼快了。”與其反之，小修則是感歎地說。
“是呀，記得最後一次是小智幫娜娜美姐姐送特快宅急便的時候。”小藍也跟著感歎道。
聽到他們感歎的內容，眾人心想：（喂喂喂！你們說的那個能讓小智跑得這麼快的那個娜娜美到底是何方神聖啊！難道她使用美食來誘惑小智的嗎？）
“不說這個了！我們也快點到那邊吧！”小修說。
“哦哦哦！”5
等眾人抵達神奇寶貝中心時，眾人已經不知道該用什麼詞來形容目前的情況：小智正在和皮卡丘小蜻三隻小智：‘你們是沒把我當人來看待了嗎！’正在大口大口地把他們眼前的食物送到他們那無底洞，等到他們吃飽的時候，小智可是挺著圓滾滾的肚子，看上去就像個孕婦，小蜻和皮卡丘更誇張，小蜻現在看上去就像一個大大的氣球，皮卡丘看上去都像個水老鼠瑪麗露。
“嗬嗬，我特別想知道他們是得餓成什麼樣？才會把自己吃成這樣。”小修說。
“哥哥，我待會再吃吧，我想先治療那些受傷的神奇寶貝。”小黃忽然這麼說道。
這也難怪小黃會這麼說，整個神奇寶貝中心現在可是處於非常忙碌的狀態，原因就是因為他們得救治那些被馬誌士打敗的神奇寶貝，盡管那些神奇寶貝的等級普遍很低，但數量實在太多了，喬伊小姐和吉利蛋都有些忙不過來了。
小修摸了小黃的頭，非常欣慰的說：“你有這份心我們很高興，不過先填飽肚子！不然你沒足夠的力量治療。”
“好吧。”
“大家也都快去吃吧。”小修對其他人說。
“嗯。”4
吃飽喝足後，小黃跑去幫喬伊小姐治療神奇寶貝，小修一行人則是跑到枯葉道館挑戰。
“有嘎達！（太好了！）終於可以挑戰道館了！”小智興奮的說。
“隻希望火箭隊別再來搗亂了。”小修說。
聽到這話，別說是小智，其他人也不禁打了個寒顫，他們可是親眼見識到那三人組的恐怖，本身就像個打不死的小強也就算了，可問題是他們還會隨著被打飛的次數的增加而增加實力！到後來，不用皮卡丘和小蜻，還打不飛他們！打敗他們倒是可以。
“總而言之！要是他們敢跑來打擾我神聖的道館戰的話！我非把他們碎屍萬段不可！”小智一臉凶惡地說。
“好了！別露出這麼凶惡的表情！趕緊挑戰道館吧！這次我先！”小修迫不及待地說。
“誒可額”小智眼角抽搐了起來。
小修看小智的神情不對，心裏忽然有個不好的預感：“小智，求你別告訴我是他們！”小修說最後兩個字是加重音。
“皮卡丘！對一點鍾方向的那個貨物使用電磁炮！”小智憤怒地說。
“小蜻！破壞死光！”
火箭隊（笨蛋）流星三人組一聽到他們下達的這些指令，馬上逃跑，可在小智的波導之力麵前逃跑，無疑是作死的行為，於是，他們又這樣再次被炸飛天，而一行人又聽到了那耳熟的話：“好討厭的感覺”3
不過火箭隊三人組被打飛的同時，從他們身上掉出了三張票。小霞撿了其中一張一看，竟然是聖安奴號的船票！
“聖安奴號的船票誒！我之前就想做坐這艘船了！可是船票太貴了，買不起。”小藍說。
而小霞卻說：“聖安奴號的船票？我就有啊。”說著小霞還從口袋中拿出聖安奴號的船票。
小藍看到小霞從口袋中拿出這張船票，眼珠子都快瞪出來了，下巴也快掉到地上了，對天哀嚎道：“有錢人啊”
“不過就算加上小霞你手上這張，我們還是差三個人，這樣的話我們當中就一定有三個人不能上船乘坐了。”小修說。
確實，所有人都想坐上這艘豪華遊輪，可隻有四張票，他們是七個人，不夠分。
“不好意思！你們說錯了！我手上剛好有四張票！”小霞卻出乎意料地說。
“納尼！”5（小黃還在神奇寶貝中心給神奇寶貝治療。）
“不信你們看！”小霞又從口袋裏拿出了三張聖安奴號的船票。
這下子別說是小藍，其他人也作出了和小藍一樣驚訝的表情，膜拜說：“土豪啊”
“這三張船票是姐姐們給我的，她們說她們還得鎮守道館，所以她們就把她們自己的票偷偷交給我，說讓我到枯葉市再幫你們再買三張票。”小霞說。
小修不禁在心裏感歎道：（這劇情改變的也太誇張了吧！小霞變成了超級土豪！本來隻有三個人坐聖安奴號，現在變成了七個人，我現在特別想知道，還有什麼劇情會遭到改變？莫非聖安奴號不會沉！那樣也不錯！）
“哥哥？你們站在門口幹嘛？不進去挑戰嗎？”這時，從神奇寶貝中心趕來的小黃說。
“啊！是小黃啊，那些神奇寶貝沒問題了吧？”塞蕾娜問。
“沒問題了！神奇寶貝們的傷我和喬伊小姐都治好了！現在隻需靜養就行了。”
“這樣啊。”
“我是真新鎮的小智！前來挑戰枯葉道館！”此時，先行一步跑進去的小智對裏頭大喊道。